MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack plasmid pMC5_1

Total Repeats: 447

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017041	T	6	6	732	737	0 %	100 %	0 %	0 %	383479186
2	NC_017041	T	6	6	742	747	0 %	100 %	0 %	0 %	383479186
3	NC_017041	TAT	2	6	803	808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479186
4	NC_017041	ATT	2	6	812	817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479186
5	NC_017041	TAG	2	6	850	855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479186
6	NC_017041	CTA	2	6	880	885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479186
7	NC_017041	AAT	2	6	894	899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479186
8	NC_017041	ATT	2	6	932	937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479186
9	NC_017041	CAA	2	6	943	948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479186
10	NC_017041	AGC	2	6	953	958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479186
11	NC_017041	T	6	6	971	976	0 %	100 %	0 %	0 %	383479186
12	NC_017041	TGA	2	6	1020	1025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479186
13	NC_017041	TAT	2	6	1036	1041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479186
14	NC_017041	TCAT	2	8	1050	1057	25 %	50 %	0 %	25 %	383479186
15	NC_017041	TTGTT	2	10	1128	1137	0 %	80 %	20 %	0 %	383479187
16	NC_017041	GTA	2	6	1175	1180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479187
17	NC_017041	T	8	8	1192	1199	0 %	100 %	0 %	0 %	383479187
18	NC_017041	CAT	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479187
19	NC_017041	GAA	2	6	1395	1400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479188
20	NC_017041	GCT	2	6	1437	1442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479188
21	NC_017041	ATT	2	6	1446	1451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479188
22	NC_017041	GAA	2	6	1491	1496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479188
23	NC_017041	GAAA	2	8	1583	1590	75 %	0 %	25 %	0 %	383479188
24	NC_017041	AGA	3	9	1622	1630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479188
25	NC_017041	TATGA	2	10	1692	1701	40 %	40 %	20 %	0 %	383479188
26	NC_017041	AGAA	2	8	1736	1743	75 %	0 %	25 %	0 %	383479188
27	NC_017041	A	6	6	1763	1768	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
28	NC_017041	ATG	2	6	1795	1800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479188
29	NC_017041	T	6	6	1809	1814	0 %	100 %	0 %	0 %	383479188
30	NC_017041	AGG	2	6	1820	1825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383479188
31	NC_017041	AGA	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479188
32	NC_017041	A	6	6	1904	1909	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
33	NC_017041	GTATG	2	10	1935	1944	20 %	40 %	40 %	0 %	383479188
34	NC_017041	AT	3	6	2072	2077	50 %	50 %	0 %	0 %	383479188
35	NC_017041	GAA	2	6	2121	2126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479188
36	NC_017041	A	7	7	2207	2213	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
37	NC_017041	AT	3	6	2275	2280	50 %	50 %	0 %	0 %	383479188
38	NC_017041	A	6	6	2316	2321	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
39	NC_017041	A	6	6	2343	2348	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
40	NC_017041	AAG	2	6	2350	2355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479188
41	NC_017041	ATT	2	6	2432	2437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479188
42	NC_017041	AGGA	2	8	2440	2447	50 %	0 %	50 %	0 %	383479188
43	NC_017041	AT	3	6	2551	2556	50 %	50 %	0 %	0 %	383479188
44	NC_017041	CTA	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479188
45	NC_017041	AGA	2	6	2615	2620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479188
46	NC_017041	GTA	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479188
47	NC_017041	A	6	6	2742	2747	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
48	NC_017041	TTA	2	6	2773	2778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479188
49	NC_017041	ATA	2	6	2806	2811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479188
50	NC_017041	GTT	2	6	2816	2821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479188
51	NC_017041	GCA	2	6	2826	2831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479188
52	NC_017041	TGA	2	6	2894	2899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479188
53	NC_017041	AAGAA	2	10	2920	2929	80 %	0 %	20 %	0 %	383479188
54	NC_017041	AAG	2	6	2932	2937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479188
55	NC_017041	ATG	2	6	2947	2952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479188
56	NC_017041	ACA	2	6	3066	3071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479188
57	NC_017041	A	6	6	3114	3119	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
58	NC_017041	AGA	2	6	3143	3148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479188
59	NC_017041	GAA	2	6	3163	3168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479188
60	NC_017041	TTA	2	6	3173	3178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479188
61	NC_017041	AAC	2	6	3188	3193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479188
62	NC_017041	GA	3	6	3240	3245	50 %	0 %	50 %	0 %	383479188
63	NC_017041	ACA	2	6	3251	3256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479188
64	NC_017041	ATA	2	6	3270	3275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479188
65	NC_017041	AGT	2	6	3377	3382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479188
66	NC_017041	AAGG	2	8	3399	3406	50 %	0 %	50 %	0 %	383479188
67	NC_017041	GCA	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479188
68	NC_017041	GTT	2	6	3507	3512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479188
69	NC_017041	TAA	2	6	3586	3591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479188
70	NC_017041	TAC	2	6	3605	3610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479188
71	NC_017041	CAT	2	6	3630	3635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479188
72	NC_017041	ATG	2	6	3664	3669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479188
73	NC_017041	AGC	2	6	3687	3692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479188
74	NC_017041	ACT	2	6	3711	3716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479188
75	NC_017041	TAC	2	6	3731	3736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479188
76	NC_017041	ATAAA	2	10	3763	3772	80 %	20 %	0 %	0 %	383479188
77	NC_017041	AAC	2	6	3812	3817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479188
78	NC_017041	AGA	2	6	3818	3823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479188
79	NC_017041	AGAT	2	8	3838	3845	50 %	25 %	25 %	0 %	383479188
80	NC_017041	TAAA	2	8	3952	3959	75 %	25 %	0 %	0 %	383479188
81	NC_017041	TTAA	2	8	3984	3991	50 %	50 %	0 %	0 %	383479188
82	NC_017041	TTGC	2	8	4050	4057	0 %	50 %	25 %	25 %	383479188
83	NC_017041	TAAAT	2	10	4160	4169	60 %	40 %	0 %	0 %	383479188
84	NC_017041	CTT	2	6	4174	4179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383479188
85	NC_017041	AGA	2	6	4205	4210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479188
86	NC_017041	A	7	7	4302	4308	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
87	NC_017041	TCTTT	2	10	4331	4340	0 %	80 %	0 %	20 %	383479188
88	NC_017041	TAA	2	6	4388	4393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479188
89	NC_017041	A	8	8	4403	4410	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
90	NC_017041	TGAT	2	8	4423	4430	25 %	50 %	25 %	0 %	383479188
91	NC_017041	TAA	2	6	4463	4468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479188
92	NC_017041	AG	3	6	4491	4496	50 %	0 %	50 %	0 %	383479188
93	NC_017041	TAA	2	6	4544	4549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479188
94	NC_017041	ATA	2	6	4582	4587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479188
95	NC_017041	A	7	7	4671	4677	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
96	NC_017041	TAA	2	6	4712	4717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479188
97	NC_017041	AAGG	2	8	4794	4801	50 %	0 %	50 %	0 %	383479188
98	NC_017041	GAG	2	6	4807	4812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383479188
99	NC_017041	A	6	6	4960	4965	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
100	NC_017041	ATG	2	6	4974	4979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479188
101	NC_017041	TTG	2	6	5053	5058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479188
102	NC_017041	CTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479188
103	NC_017041	TGA	2	6	5153	5158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479188
104	NC_017041	CAA	2	6	5187	5192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479188
105	NC_017041	AAT	2	6	5205	5210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479188
106	NC_017041	ATA	2	6	5221	5226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479188
107	NC_017041	ATA	2	6	5244	5249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479188
108	NC_017041	TCC	2	6	5255	5260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383479188
109	NC_017041	GAA	2	6	5289	5294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479188
110	NC_017041	ATT	2	6	5307	5312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479188
111	NC_017041	TTA	2	6	5371	5376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479188
112	NC_017041	A	7	7	5406	5412	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
113	NC_017041	ATG	2	6	5473	5478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479188
114	NC_017041	TA	3	6	5485	5490	50 %	50 %	0 %	0 %	383479188
115	NC_017041	TGA	2	6	5522	5527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479188
116	NC_017041	TA	3	6	5530	5535	50 %	50 %	0 %	0 %	383479188
117	NC_017041	CAA	3	9	5577	5585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479188
118	NC_017041	AGCC	2	8	5593	5600	25 %	0 %	25 %	50 %	383479188
119	NC_017041	CAAAA	2	10	5629	5638	80 %	0 %	0 %	20 %	383479188
120	NC_017041	GTG	2	6	5689	5694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383479188
121	NC_017041	TAG	2	6	5708	5713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479188
122	NC_017041	CT	3	6	5723	5728	0 %	50 %	0 %	50 %	383479188
123	NC_017041	TAA	2	6	5732	5737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479188
124	NC_017041	TTA	2	6	5740	5745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479188
125	NC_017041	CAA	2	6	5776	5781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479188
126	NC_017041	ATG	2	6	5830	5835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479188
127	NC_017041	TAA	2	6	5840	5845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479188
128	NC_017041	TAAA	2	8	5899	5906	75 %	25 %	0 %	0 %	383479188
129	NC_017041	A	7	7	5904	5910	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
130	NC_017041	A	7	7	5999	6005	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
131	NC_017041	CAA	2	6	6018	6023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479188
132	NC_017041	TGC	2	6	6078	6083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479188
133	NC_017041	ATA	2	6	6298	6303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479189
134	NC_017041	TGA	2	6	6321	6326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479189
135	NC_017041	T	7	7	6329	6335	0 %	100 %	0 %	0 %	383479189
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137	NC_017041	TAT	2	6	6480	6485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479190
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397	NC_017041	AG	3	6	22369	22374	50 %	0 %	50 %	0 %	383479205
398	NC_017041	TGA	2	6	22488	22493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479205
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401	NC_017041	GAA	2	6	22540	22545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479205
402	NC_017041	AGA	2	6	22585	22590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479205
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